Лечение эндоцервицита обыкновенно проводится в два этапа. Вначале требуется устранить возбудителя инфекции, для чего будет подобран антибиотик, способный уничтожить конкретного возбудителя. После избавления от инфекции необходимо восстановить нормальную микрофлору влагалища, чтобы избежать рецидива. Важно учитывать, что терапия будет успешной только если будут ликвидированы все сопутствующие воспалительные гинекологические недуги.